RESUMO O crescimento da população indígena e a regularização de terras trazem demandas para o restabelecimento de práticas agrícolas tradicionais. O manejo tradicional do milho (Zea mays L.) em tribos indígenas dos estados de Roraima e Santa Catarina representa um cenário de erosão genética e cultural. Esse trabalho busca compreender a relação histórica e cultural existente entre os grupos indígenas e o cultivo do milho. São utilizadas ferramentas de etnobotânica para entender a dinâmica do milho nos agroecossistemas indígenas. Em registros arqueológicos na América do Sul, a difusão inicial do milho coincide com a expansão da agricultura de grupos Jê. Uma segunda onda difundiu a intensificação do milho e a complexificação social, coincidindo com a expansão Aruak e Tupi-Guarani. O estado do cultivo do milho em aldeias Wapixana (Aruak), Macuxi, Taurepang, Waimiri Atroari (Karib), Kaingang, Xokleng (Jê) e Guarani (Tupi-Guarani) representam estágios diferentes do declínio da importância do milho. A perda de população e redes de troca de sementes, acréscimo de novas culturas como a banana, e a erosão de práticas religiosas tradicionais contribuem para essa perda. Os Guarani registram esforços de manter métodos tradicionais de manejo do milho, associadas às práticas religiosas e cosmologia do grupo. A base genética deste manejo, deduzida de práticas observadas em Santa Catarina e registradas na literatura, consiste no manejo de populações de milho com cores diferentes no pericarpo e aleurona das sementes. Essas cores permitem visualizar as atividades de transposons- usinas moleculares de mutações que geram diversidade alélica. Permitem, ainda, segregar e gerenciar a taxa de mutação em diferentes populações. A “religião do milho” dos Guarani pode ser a base tecnológica da intensificação do milho observado nos registros arqueológicos. JUSTIFICATIVA A interdisciplinaridade é a chave para o desenvolvimento desta pesquisa. O estudo do milho nos agroecossistemas indígenas exige observações agronômicas, conhecimentos de história e pré-história do milho nas Américas e conhecimentos de genética do milho gerados nas últimas décadas. A integração de conhecimentos permite a compreensão da relação das estruturas sociais indígenas com a genética complexa do milho. A partir deste entendimento, podemos reinterpretar a história das práticas agrícolas nas Américas, e ainda colher subsídios para o manejo de populações crioulas de milho. As práticas tradicionais indígenas oferecem ferramentas poderosas de melhoramento genético, pouco compreendidas na agronomia tradicional. BIBLIOGRAFIA GENÉTICA ANDERSON, E. 1967. Plants, Man and Life. University of California Press. 2a. ed. p.214–219. ANDERSON, E.G. 1924. 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Professor Adjunto do Depto. de Engenharia Rural, CCA/UFSC, supervisor do Laboratório de Biotecnologia Neolítica